Học viện Ma thuật Hoàng gia Alzano nổi tiếng là nơi đào tạo những ma thuật sư hàng đầu thế giới. Tuy nhiên, cuộc sống của các học sinh tại đây lại bị xáo trộn khi Sistine Fibel và người bạn thân Rumia Tingel phải đối mặt với một giảng viên tạm thời mới, Glenn Radars. Glenn là một người có tính motphim cách lười biếng, không có năng lực giảng dạy và chỉ thích ngủ trong giờ học.
Dù bề ngoài có vẻ tầm thường và thiếu động lực, thực chất Glenn lại là một cựu sát thủ tài năng từng phục vụ trong Quân đội Hoàng gia. Anh sở hữu loại ma thuật có khả năng khắc chế mọi loại phép thuật, điều này khiến cho câu chuyện trở nên thú vị hơn.
Khi học viện phải đối mặt với các thế lực hắc ám đang dần tấn công, Glenn buộc phải thức tỉnh sức mạnh thực sự của mình. Anh không chỉ là một giáo viên không mấy chăm chỉ mà còn là người bảo vệ các học sinh, sẵn sàng đứng lên chiến đấu để bảo vệ những gì quý giá nhất.
Câu chuyện trong Ông Thầy Vi Diệu không chỉ đơn thuần xoay quanh việc học tập ma thuật mà còn khám phá mối quan hệ giữa thầy và trò, cũng như sức mạnh tiềm ẩn mà mỗi người có thể khai thác khi đối diện với thử thách. Những tình huống hài hước, cảm động và căng thẳng sẽ làm cho người xem không thể rời mắt khỏi màn hình.