Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 5) kể về cuộc hành trình của đặc vụ FBI Fox Mulder, do David Duchovny thủ vai. Fox Mulder, với nỗi đau mất mát người em gái, đã tham gia vào các cuộc điều tra tại “X-files” với hy vọng tìm ra tung tích của em mình, người mà anh tin rằng đã bị người ngoài Trái Đất bắt cóc.
Trong khi Mulder rất tin tưởng vào sự tồn tại của người ngoài hành tinh thì đặc vụ Dana Scully, do Gillian Anderson diễn xuất, lại không chia sẻ niềm tin đó. Ban đầu, Scully hoài nghi về những gì Mulder nói, nhưng qua những bằng chứng cụ thể và các vụ án kỳ lạ mà họ trải qua cùng nhau, cô dần dần mở lòng và tin vào những điều huyền bí.
Tuy nhiên, đến cuối phim, sự xuất hiện của Fox Mulder giảm dần và thay vào đó là nhân vật mới – đặc vụ John Doggett, do Robert Patrick thể hiện. John Doggett có những nghi ngờ về tính xác thực của các vụ án trong X-files, nhưng chính đặc vụ Scully đã trở thành người thuyết phục Doggett tin vào những điều kỳ lạ mà họ đang điều tra.
Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 5) không chỉ là một cuộc phiêu lưu điều tra mà còn là hành trình khám phá niềm tin và sự thật của các nhân vật, từ đó mở ra nhiều câu hỏi về hiện tượng motphims1.com huyền bí và sự tồn tại của những điều chúng ta chưa thể lý giải.